在上海自貿區代理記賬報稅操作流程如下：

　　1.開展稅務咨詢，包括電話咨詢和網上咨詢，受聘常年稅務顧問。

　　2.辦理稅務登記、變更稅務登記和注銷稅務登記。

　　3.辦理發票領購、繳銷手續。

　　4.辦理各項納稅申報和扣繳稅款報告，并提供電子申報服務。

　　5.辦理繳納稅款，滯納金，補稅；申請減稅、免稅、延期繳稅、出口退（免）稅；代購印花稅票。

　　6.審查納稅情況；稽核應納稅額，辦理稅收清算；受托進行年度查賬，單項專題查賬。

　　7.稅收籌劃，根據企業類型和經營特點，幫助企業爭取最大限度地享受優惠政策；為企業在日常經營及對內對外投資、簽訂合同、招標、合并、分立、改組改 制等方面，提供最合理的節稅方案；為新辦企業確定最合理納稅方案；幫助企業減少稅收成本，降低納稅風險；在合法的前提下，實現最小納稅，提高經濟效益。

　　8.涉稅協調，在稅收稽查、稅收爭議、稅收處罰等方面，充分運用豐富的涉稅經驗和對稅法的深刻、正確理解，代企業與主管稅務機關進行溝通協調，力求最合理地納稅。

　　9.根據公司的具體情況協助申請享受最優惠的稅收優惠政策和地方財政返還政策。

　　10.幫助公司協調與主管稅局關系，并代理處理一些涉稅事宜。